乐土助力临床参数与肿瘤突变负荷TMB相关性研究
近日，乐土医学检验与江西省肿瘤医院专家合作发表论文“Clinical and molecular impacts of tumor mutational burden in histological and cytological specimens from cancer patients”于Annals of Translational Medicine期刊上，乐土作为并列通讯和并列第一作者深度参与该项研究。
文章导读
肿瘤突变负荷(TMB)是评估免疫检查点抑制剂(ICI)疗效的有效生物标志物之一，然而，它与临床参数间的关系尚未被充分探讨。乐土医学检验与江西省肿瘤医院合作，通过测序分析1504例肿瘤组织样本和496例血液样本来探讨TMB与年龄、肿瘤类型和基因突变之间的关系。
研究发现
1）对于血液样本，与年龄≤56岁或年龄在56岁~68岁的患者相比，年龄≥68岁的患者TMB明显升高。携带KRAS p.G12突变与KRAS其他变异患者的TMB具有显著差异。
2）对于组织样本，TMB在年龄53岁~65岁之间表达较高，在年龄≥65岁人群中较低。TMB在肺腺鳞癌(ASC)、肺腺癌(LUAD)、肺鳞状细胞癌(LUSC)、非小细胞肺癌(NSCLC)和小细胞肺癌(SCLC)等不同的肿瘤组织类型间存在显著差异。TMB高低与KRAS p.G12A、p.G12C、p.G12D、p.G12R、p.G12S、p.G12V等KRAS突变相关。
总结
TMB可能与年龄、肿瘤类型以及KRAS突变相关。作为免疫检查点抑制剂的一个潜在生物标志物，分析年龄、肿瘤类型和KRAS突变可能为TMB的评估提供更有益的帮助。
文章具体解读
方法
本研究共纳入了2019到2021年间乐土与江西省肿瘤医院合作检测的496例血液和1504例肿瘤组织样本，通过基因检测及统计学分析探讨TMB与临床样本年龄、肿瘤类型和基因突变（KRAS和EGFR）之间的关系。
文章所有研究均符合赫尔辛基宣言（2013年修订），并通过了江西省肿瘤医院伦理委员会批准（编号：2021ky229），所有患者均签署了知情同意书。
分析结果/样本特征
研究共纳入496例血液样本和1504例组织样本，血液样本的年龄范围为（61.58 ±12.48）岁，男:女=314:182；组织样本的年龄范围为（57.42±14.67）岁，男:女=866:638。样本的具体信息见表1。
Table 1 Characteristics of blood samples and tissue samples
TMB与年龄、肿瘤类型及基因突变的关系
在496例血液样本中，TMB值在年龄≤56岁和年龄在56岁到68岁之间的人群中没有显著差异，而在年龄≥68岁的人群中显著升高（图1A，P<0.05，Kruskal-Wallis）。其中12例为MSI-H，484例为MSS/MSI-L（图1B）。如图1C所示，分析结果表明MSI的比值（%）与TMB没有线性相关性（R=−0.093, P=0.038）。
通过评估肿瘤类型和TMB的关系发现，TMB和肿瘤类型无关，在肺腺鳞癌、肺腺癌、肺鳞癌、非小细胞肺癌和小细胞肺癌中TMB无差异（图1D，P=0.33, Kruskal-Wallis）。
图1-血液样本中TMB与年龄、MSI或肿瘤类型之间的关系
A. TMB在年龄≤56岁（n=157），年龄56-68岁（n=177）和年龄≥68岁（n=161）之间的表达差异。
B&C. MSI-H（n=12）和MSS/MSI-L（n=484）的情况及血液样本中MSI比值与TMB的关系。
D. 肺腺鳞癌（n=0）、肺腺癌（n=131）、肺鳞癌（n=7）、非小细胞肺癌（n=3）和小细胞肺癌（n=3）样本中的TMB情况。
在1390例组织样本中，如图2所示，与年龄≤53岁人群相比，TMB值在年龄≥65岁和年龄在53岁到65岁之间的人群中没有显著差异，在53岁到65岁人群中TMB显著升高，在≥65岁人群中TMB显著降低（图2A，P<0.05, Kruskal-Wallis）。其中33例为MSI-H，1357例为MSS/MSI-L（图2B）。如图2C所示，这些结果表明MSI的比值（%）与TMB没有线性相关性（R=0.29, P<2.2e-16）。
通过评估肿瘤类型和TMB的关系发现，TMB与肿瘤类型相关（图2D, P=0.037, Kruskal-Wallis），在肺腺鳞癌、肺腺癌、肺鳞癌、非小细胞肺癌和小细胞肺癌间存在差异。而且TMB在结直肠癌的血液样本和组织样本中均存在差异（图2E，P=0.036, Wilcoxon）。
图2-组织样本中TMB与年龄、MSI或肿瘤类型之间的关系
A. TMB在年龄≤53岁（n=489），年龄53-65岁（n=497）和年龄≥65岁（n=512）之间的表达差异。
B&C. MSI-H（n=33）和MSS/MSI-L（n=1357）的情况及组织样本中MSI比值与TMB的关系。
D. 肺腺鳞癌（n=1）、肺腺癌（n=222）、肺鳞癌（n=26）、非小细胞肺癌（n=3）和小细胞肺癌（n=8）样本中TMB表达情况。
E. TMB在结直肠癌血液样本（n=4）和组织样本（n=20）中的表达情况。
基因突变状态与TMB相关。既往部分研究表明，携带EGFR基因突变的NSCLC患者往往具有较低的TMB，而KRAS与较高的TMB相关。
在我们的研究中，血液样本中的Kruskal-Wallis分析结果表明，KRAS p.G12A、p.G12C、p.G12D、p.G12R、p.G12V和KRAS其他突变之间的TMB没有显著差异（P=0.17）（图3A，P=0.17, Kruskal-Wallis），但根据Wilcoxon 检验，KRAS其他突变和KRAS p.G12突变之间的TMB表达存在显著差异（P=0.013，图3B）。
图3-血液样本中TMB和癌症相关基因突变的关系
C. TMB在KRAS其他突变（n=1333）和KRAS p.G12（n=171）中的表达情况。
